因了玄女、天女魃和应龙等的帮助，蚩尤在与黄帝的大战中，被活捉。

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像蚩尤这样的万恶的元凶，黄帝当然不会放过他，所不同的是杀他的方法。

第一种传说比较简单，说黄帝抓住蚩尤之后，就马上在涿鹿把他杀掉。杀他的时候，怕他逃跑，还不敢把他身上的枷锁镣铐取掉。直到确认蚩尤被杀死了，才从他身上摘下血染的枷锁，抛掷在大荒之中。这枷锁顿时化作了一片枫林，每一片树叶上面都仿佛有着蚩尤的斑斑血迹。

第二种说法是，黄帝虽然打败了蚩尤，但是直到冀州的中部才把他捉住。然后砍下他的头颅，使之身首异处，所以那个地方就叫做"解"，即如今山西的解县。附近有一个盐池，叫做解池，池里的盐水都是红色的，人们说那就是蚩尤流的血。

至于他的头和身体却被搬到了如今的山东，在寿张县和巨野县分别埋葬起来。据说这两个县都有蚩尤的墓，寿张县的居民每年十月都要祭祀蚩尤，这个时候就会看到一道红色的雾气从蚩尤墓顶冲出来，好像悬挂着的一面旗，人们叫它"蚩尤旗"。

蚩尤的遗迹，除了这几处之外，又有说法是说冀州地方有人挖掘到了巨大的骷髅残片，像钢铁般坚固，想来便是所谓的蚩尤的骨肉了。还有人得到了一颗蚩尤的牙齿，足有两尺长，也是怎么敲都敲不破。

说来，蚩尤其实不是单个人的名字，而是一个勇猛的巨人族的名字。（据茅盾《中国古代神话ABC》）而且《路史·后纪·蚩尤传》说："阪泉氏蚩尤，姜姓，炎帝之裔也。"

这说明蚩尤族其实是炎帝的后裔，我们现在所说的炎黄子孙就包括了蚩尤一族。炎帝之前和黄帝打过一仗，败了，后来炎帝部落里的蚩尤族不服气，继续和黄帝干仗。为的就是一雪前耻。

还有一点比较出人意料，所谓的跟着蚩尤和黄帝干仗的苗民，其实也是黄帝的后裔而不是炎帝的后裔。只是因为他们受到黄帝的歧视，又受到蚩尤的威逼利诱，才跟着揭竿而起的。所以他们也很无辜。

据说，在涿鹿之战中，上古的巨人族蚩尤被灭绝。但是炎帝一族和苗民却并没有灭绝。而且后来，炎帝的后裔中又出现了很多勇猛的战士与黄帝一族对抗，比如共工，就是为了跟黄帝的后裔颛顼对抗才头触不周山的。

参考资料：袁珂《中国神话传说》。