1477年正月（成化十三年），明宪宗朱见深组织了新的内廷机构?，以汪直为提督，厂址设在灵济宫前，以旧灰厂为厂署总部。由于灵济宫在皇城西面，因此称之为"?西厂"。专门负责为皇帝打探消息，协助皇帝监视天下。

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不过当时的明朝已经有了东厂和锦衣卫两大特务机构，职权与西厂基本重合，为什么明宪宗朱见深又另外设置一个西厂？

出警入跸图，可见途中锦衣卫

要说西厂，就必须先说锦衣卫和东厂。

锦衣卫，前身为明太祖朱元璋设立的"?拱卫司"，后改称"?亲军都尉府"，统辖仪鸾司，掌管皇帝仪仗和侍卫，说白了就是仪仗队兼皇宫的亲卫队。

后来明太祖朱元璋为了防止功臣集团和老朱家的皇亲国戚等集团势力过大，出现结党营私、扰乱朝纲、干涉皇位继承人选择等危害中央集权的行为，于1382年（洪武十五年）裁撤亲军都尉府与仪鸾司，改置锦衣卫。

锦衣卫主要负责"?掌直驾侍卫、巡查缉捕"，从事侦察、逮捕、审问、审讯等活动，也参与收集军情、策反敌将的工作，性质有点像美国的国家安全局、特勤局、联邦调查局和中央情报局的结合体，拥有进行不公开审讯的特权，凌驾于刑部、大理寺和都察院之上，其首领称为锦衣卫指挥使，一般由皇帝的亲信武将担任，直接对皇帝负责。

总之一句话，因为皇权直属，所以锦衣卫权大势也大，就算皇亲国戚被他盯上，那也得乖乖配合，没有什么特权可讲。

明武宗即位时，他身边有八个太监最受信任，即刘瑾、张永、谷大用、马永成、高凤、罗祥、魏彬、丘聚等，这些人被称作"八虎"。虽然"八虎"都是皇帝身边的红人，但他们之间也有矛盾。当时，马永成负责掌管东厂，谷大用负责掌管西厂，而刘瑾掌管着司礼监，三人之间也经常发生争执。

刘瑾虽说掌管司礼监，但由于没能兼管东西二厂，导致手中的权势大打折扣。于是，刘瑾向明武宗提出建立新的特务机构，明武宗对刘瑾非常信任，也就同意了。于是"改惜薪司外薪厂为办事厂，荣府旧仓地为内外事厂"，当时被人们称作内行厂。为什么说内行厂的权势大呢？因为内行厂不仅可以监视官民，还可以监视东厂、西厂、锦衣卫。

至此刘瑾手中已经掌握了两个机构，一个是司礼监，另一个就是内行厂，正是由于他掌握着这两个机构，再加上明武宗的信任，他才可以权倾朝野，为所欲为。内行厂开创了一个先例，"罪无轻重皆决杖，永远戍边，或枷项发遣"。也就是说，无论罪行轻重，都要永久发配边疆，有的还要戴枷流放，就像《水浒传》中的那样。

不过内行厂枷锁非常沉重，"枷重至百五十斤"，许多人熬不过数日就死了。此外，刘瑾利用内行厂打击异己，同时迫害那些正直的官员以及无辜的百姓。据记载，"尚宝卿顾璿、副使姚祥、工部郎张玮、御史王时中辈并不免，濒死而后谪戍。御史柴文显、汪澄以微罪至凌迟。官吏军民非法死者数千。"

刘瑾的所作所为引起了许多大臣的不满，他们都在等待着一个机会。正德五年，宁夏发生叛乱，朝廷派史杨一清、太监张永前去平叛。叛乱结束，张永回京向明武宗揭露刘瑾的罪行。明武宗大怒，亲自前往刘瑾家查抄，之后下诏"磔于市，枭其首"。随着刘瑾以及党羽的覆灭，内行厂也被废除。